本试剂盒采用改进的CTAB抽提液能高效裂解细胞并灭活细胞内核酸酶,经过氯仿抽提后,真菌基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于纤维素膜上,再通过一系列快速的漂洗、离心的步骤,进一步将蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将高纯度基因组DNA从纤维素膜上洗脱下来。我公司采用进口吸附柱,能高效、专一的吸附DNA。使用本试剂盒提取的DNA可适用于各种常规操作,包括酶切、PCR、测序、连接等实验。
【提取步骤】
1. 取适量真菌组织(新鲜组织 100 mg 或干重组织 50 mg)在研钵中加入液氮充分碾磨成细粉。转移细粉到一个 2.0ml 离心管,不要解冻,加入 800μl 65℃预热的裂解液FPL,剧烈涡旋振荡充分混匀。
v 如果没有液氮,可以将组织剪成细块,加入800μl 裂解液FPL后迅速研磨,直至无可见块状物,将研磨器中溶液和组织转移到一个 2.0ml 离心管中,剧烈涡旋振荡充分混匀。如果依然有大量难以裂解的团块,应该离心去除,取上清再继续以下操作。
2. 向溶液中加入约5μl RNase A (10 mg/ml),充分混匀室温静置3分钟。
3. 65℃水浴 10-60 分钟, 在水浴过程中颠倒离心管以混合样品2-3次。
v 水浴时间视组织材料而定,新鲜组织65℃水浴 10分钟即可,其余难裂解的组织可以适当延时。
4. 加入 800μl氯仿/异戊醇(体积比 24:1)(自备),短暂涡旋振荡充分混匀,12,000rpm 离心10分钟。
v 振荡幅度过大,时间过长都会打断基因组DNA,造成DNA纯度和产量降低。
5. 小心吸取上清到一个新的 1.5ml 离心管, 注意不要吸到界面物质,宁缺毋滥。
6. 估算上清量, 加入1/4体积的异丙醇, 立即颠倒混匀数次。
v 此步骤中充分混匀非常重要,混匀不充分严重降低产量。
7. 将上一步混合物(包括可能有的沉淀)加入一个吸附柱 C 中,(吸附柱放入收集管中)12,000 rpm 离心60 秒,倒掉收集管中的废液。
8. 加入600μl漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。
9. 加入400μl 漂洗液WB, 12,000rpm离心30秒,弃掉废液。
10. 将吸附柱放回空收集管中,12,000rpm离心60秒,尽量除去漂洗液。
v 漂洗液中乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。也可以将吸附柱开盖,置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的乙醇。
11. 小心取出吸附柱 ,放入一个灭菌的离心管中,在吸附膜的中间部位加 50μl 洗脱缓冲液EB或者TE(洗脱缓冲液事先在60-70℃水浴中加热效果更好),室温放置 2 分钟,12,000rpm离心1分钟。如果需要较多量DNA,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,再离心1分钟。
v 洗脱体积越大, 洗脱效率越高。如果需要DNA浓度较高, 可以适当减少洗脱体积,但是最小体积不少于 30μl。
v 本试剂盒提供两种洗脱液EB和TE。EB(10mM Tris-HCl ,pH8.0),不含EDTA,不影响下游酶切、连接等反应。如DNA需长期保存,可以用TE(10mM Tris-HCl,1mM EDTA,pH8.0)洗脱,EDTA可能影响下游酶切反应。