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菌种鉴定

日期时间:2016-02-24     文章来源:本站     点击量:2828


服务简介

    应用分子生物学方法从遗传进化角度阐明微生物种群之间的分类学关系,是微生物分类学研究普遍采用的鉴定方法。比如通过PCR方法扩增细菌16S rDNA/16S-23S rDNA区间序列、酵母18S rDNA/26S rDNAD1/D2)序列及真菌18S rDNA/ ITS1/ITS2序列,并进行DNA测序,与GenBank中的已知序列进行同源性比较后,判定细菌种类,将细菌划分到属或种。

服务内容

v  细菌16S rDNA部分序列解析:扩增细菌16S rRNA的全长序列,只进行一个测序反应(有效序列500~600 bp),即可得到含有部分种属特异性的16S信息,是一种较为经济便捷的鉴定方法。

v  细菌16S rDNA全序列解析:扩增细菌16S rRNA的全长序列,约1,500 bp左右,需进行2-3个测序反应,以得到较为全面的种属特异性信息。

v  酵母和真菌的ITS基因,包括ITS1ITS2两部分,进化速度快,具有多态性,适于对亲缘关系较近的菌株进行区分鉴定。


 

服务说明

1. 低温运输相关样品,接收的样品形式为:基因组DNA、经菌种分离后带有单菌落的甘油菌、新鲜平板或斜面。

2. 基因组DNA的浓度大于10 ng/ ul,体积不少于20 ul,且无明显降解。

3. 由于革兰氏阳性细菌的细胞壁较厚,采用试剂盒常规方法较难破壁,请提供基因组DNA

4. 如果测序结果出现背景峰或套峰,视为菌种样品不纯,本公司将收取全额实验费用。

5. 鉴定结果一般可以鉴定到种。个别菌种由于微生物数据库相关数据缺乏,只能鉴定到属。如遇这种情况,正常收费。

 

服务报价

 服务内容

价格()

周期

交付内容

细菌16s rDNA部分序列分析

询价

10-15个工作日

实验报告(包括PCR产物照片、菌种鉴定NCBI参考结果等)、测序彩色波形图、序列碱基图。

真菌16s rDNA部分序列分析

询价 

10-15个工作日

真菌ITS/18s全序列分析

询价

10-15个工作日

注:以上实验费用及周期是针对正常实验样品制定的,样品特殊或样品多时除外。



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